【佳学基因检测】非典型BRAF突变基因检测及黑色素瘤靶向药物治疗

非典型BRAF突变基因检测

BRAF基因是一种编码B-raf蛋白的基因，该蛋白在许多生物体内起到信号转导的作用，从而影响细胞生长和分裂。在人类中，一些特定的BRAF突变已经与各种类型的癌症，包括黑色素瘤、结肠癌、肺癌和甲状腺癌等联系在一起。

当我们说"非典型BRAF突变"，我们通常是指非V600E的BRAF突变。BRAF V600E突变是最常见的BRAF突变，它涉及到基因的第600位氨基酸由正常的赖氨酸（V）变为酸性氨基酸谷氨酸（E）。然而，还有许多其他类型的BRAF突变，这些就是所谓的"非典型"突变。

对于非典型BRAF突变的检测，通常需要使用一种叫做下一代测序（NGS）的技术。这是一种高通量测序技术，可以同时测定多达数百万的DNA序列。NGS能够检测出不仅包括常见的BRAF V600E突变，还包括其他任何可能出现的BRAF突变。这种方法比传统的单一基因测试更灵活，更准确，因此已经成为临床中广泛使用的主要方法。

黑色素瘤中的非典型BRAF突变的靶向药物查找

具有非典型BRAF突变的黑色素瘤包括各种遗传改变,通常分为V600和非V600突变型。每种突变进一步根据其信号机制和激酶活性被分类为I、II或III类,导致不同程度的分子调控失常。罕见的BRAFV600突变包括V600R/D/M/L,特征性地发现于有长期日光暴露史的老年男性患者,为激酶激活单体。非V600突变可分类为II类(如L597P/Q/R/S, K601E, G469R/S/A)或III类(G596R, D594Y/N/G/E, D287Y),取决于形成二聚体激活RAF激酶或完全抑制激酶活性从而导致ERK信号传导悖论性激活。典型地,II和III类肿瘤呈现更具攻击性的临床过程,预后较差。非典型BRAF突变更常见于粘膜黑色素瘤。

尽管BRAF/MEK抑制剂联合治疗在V600E/K突变患者中已建立,但对于约5%的非V600 BRAF突变黑色素瘤的临床数据主要由病例报告组成,因为其罕见性和遗传异质性。在临床前研究显示MEK抑制导致磷酸化ERK信号下降后,一项I期N=1研究显示,用MEK抑制剂(TAK-733)治疗BRAF L597突变患者,肿瘤影像学部分缓解,持续24周。用trametinib治疗非典型BRAF突变或融合的患者,总反应率为33%(9例中3例),一位III类非V600突变(BRAF T470R)患者治疗反应最好(缩小87%,无进展生存期19.2个月)。一项较大回顾性队列研究评估了用BRAF抑制剂、MEK抑制剂或两者联合治疗非典型BRAF突变患者的临床反应。103例患者中,58例(56%)为罕见V600突变,38例(37%)为非V600突变,7例同时存在V600E和罕见BRAF突变[60]。96例患者接受了BRAF抑制剂、MEK抑制剂或联合治疗。治疗反应依赖于BRAF基因型,非E/K V600突变黑色素瘤用BRAF加MEK抑制剂治疗反应最好(总反应率56%,中位无进展生存期8.0个月)。非V600突变患者用BRAF和MEK抑制剂治疗的总反应率为28%(18例中5例)。

BRAF激酶融合也用MEK抑制剂作为靶点。BRAF融合的临床特征包括好发于年轻患者,病理组织型为Spitz样。6株具有代表性融合激酶的黑色素瘤细胞系的体外数据显示,根据转座的特点,RAF/MEK抑制反应不同,表达水平更高的转座相关耐药性更强。在体外和体内研究证明,在最耐药的细胞系中,第三代(αC-IN/DFG-OUT)RAF抑制剂与MEK抑制剂联合使用具有临床前治疗效果。

2015年发表的两例病例系列报告MEK抑制剂(trametinib)在之前治疗的BRAF融合转移性黑色素瘤患者中的临床疗效。两名患者症状均有改善,一名患者髓外肿瘤负荷减少90%。另一篇病例报告显示,一名SKAP2-BRAF融合的晚期黑色素瘤患者在经历免疫和达卡巴嗪治疗后,MEK抑制剂单药治疗达到部分缓解,但反应不持久,疾病最终进展。一项国际回顾性研究显示,非V600突变患者用BRAF抑制剂无抗肿瘤活性,而MEK抑制剂无论单药还是联合BRAF抑制剂治疗,总体反应率为28-40%,提示MEK抑制可能是主要治疗药物。相反,在选择的II期研究中,非E/K V600突变患者对BRAF单药或BRAF和MEK抑制剂联用反应良好。总体来看,这表明对于免疫治疗不适合或失败的激活性非V600突变患者,BRAF和MEK抑制可能有一定作用。需要进一步研究更好地定义哪些非V600突变黑色素瘤患者可以从MEK抑制剂(无论是否联合BRAF抑制剂)中获得临床获益。
 

非典型BRAF突变黑色素瘤的靶向治疗药物选择

对于罕见的V600突变(V600R/D/M/L等),BRAF抑制剂或BRAF+MEK抑制剂联合用药可能有效。

对于非V600突变,尤其是II类突变(L597等位点)和III类突变(G596等位点),MEK抑制剂单药或联合BRAF抑制剂可能有效。

对于BRAF激酶融合突变,MEK抑制剂单药或与第三代RAF抑制剂联合使用,可能有抗肿瘤活性。

不同类型的非典型突变对靶向药物的反应不同,需要根据个体的具体突变情况选择最佳的靶向治疗策略。

整体来看,MEK抑制剂在非典型BRAF突变黑色素瘤治疗中发挥重要作用。

需要更多研究结果以更好地指导非典型BRAF突变黑色素瘤的个体化靶向治疗。