【佳学基因检测】透明细胞肉瘤的靶向药物基因检测靶点：EWSR1-ATF1

清细胞肉瘤是一种罕见但极具侵袭性的恶性肿瘤,没有有效的治疗方法,其特征是表达融合基因EWSR1::ATF1。肿瘤基因解码通过高通量药物筛选发现,组蛋白脱乙酰酶抑制剂沃利那司(vorinostat)可抑制肿瘤细胞增殖,并降低EWSR1::ATF1的表达。部分基因检测机构认为EWSR1::ATF1表达降低是由于染色质访问性改变所致,然而ATAC-seq和CUT&RUN分析显示,尽管EWSR1::ATF1启动子区域组蛋白发生脱乙酰,但染色质结构仅有轻微改变。另外,肿瘤基因解码发现沃利那司处理可降低溴结构域蛋白BRD4在EWSR1::ATF1启动子区域的水平。此外,BRD4抑制剂JQ1也可降低EWSR1::ATF1的表达。肿瘤基因解码的motif分析显示,沃利那司处理抑制了转录因子SOX10,后者直接调控EWSR1::ATF1的表达,参与清细胞肉瘤的增殖。重要的是,肿瘤基因解码证明沃利那司和JQ1的联合用药可协同增强抗增殖效应和抑制EWSR1::ATF1。这些结果揭示了通过表观遗传学药物实现融合基因抑制的新机制,为融合基因相关肿瘤的治疗提供了潜在新靶点。

意义:肿瘤基因解码揭示了组蛋白脱乙酰酶抑制剂可通过表观遗传学和转录调控机制抑制清细胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表达,并确定SOX10是调控EWSR1::ATF1表达的转录因子。

透明细胞肉瘤的基因解码对清细胞肉瘤的诊断和治疗有以下几点帮助:

确认了组蛋白脱乙酰酶抑制剂(如沃利那司)可以下调清细胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表达。这为清细胞肉瘤的靶向治疗提供了潜在的药物选择。

发现了BRD4抑制剂JQ1也可以下调EWSR1::ATF1的表达。为清细胞肉瘤药物治疗提供了另一个潜在靶点。

证实了SOX10是调控EWSR1::ATF1表达的转录因子。SOX10可能也是一个治疗靶点。

显示沃利那司联合JQ1可协同增强对EWSR1::ATF1的抑制。为清细胞肉瘤的联合靶向治疗提供了理论依据。

EWSR1::ATF1是清细胞肉瘤的特征性融合基因。该研究揭示的对EWSR1::ATF1的表观遗传学调控机制,有助于肿瘤基因解码更好地理解这一融合基因在肿瘤发生中的作用。

这项研究为通过表观遗传学途径抑制肿瘤特征性融合基因提供了范例,可为其他融合基因相关肿瘤的治疗提供参考。

研究为清细胞肉瘤的精准诊断和治疗提供了理论基础和新策略。
 

肿瘤基因检测增加EWSR1::ATF1是否增加了肿瘤基因检测的全面性和准确性？

在清细胞肉瘤的基因检测中增加EWSR1::ATF1fusion基因的检测可以提高检测的全面性和准确性:

EWSR1::ATF1是清细胞肉瘤的特征性遗传学标志和致病驱动事件。检测EWSR1::ATF1可以帮助明确诊断。

大多数清细胞肉瘤表达EWSR1::ATF1。增加该项检测可以提高检出率,避免漏诊。

EWSR1::ATF1可以通过多种技术检测,如RT-PCR、FISH等。结合使用可以提高检测灵敏度。

EWSR1::ATF1水平的高低与预后相关。动态监测可以评估病情和指导治疗。

EWSR1::ATF1参与多种信号通路,是潜在治疗靶点。检测可指导后续靶向治疗。

检测EWSR1::ATF1可以区分与其类似的Ewing家族肉瘤。

一些清细胞肉瘤可能存在其他少见融合基因。检测EWSR1::ATF1有助于发现这类变异。

综上,加入EWSR1::ATF1检测,可以提高肿瘤基因检测的全面性,避免漏诊,并指导后续治疗。推荐将其纳入清细胞肉瘤的基因检测项目。