【佳学基因检测】透明细胞肉瘤靶向治疗相关基因检测研究进展

透明细胞肉瘤（Clear Cell Sarcoma)又叫做透明细胞肉瘤，是一种极为罕见的软组织肉瘤亚型,好发于青少年和年轻成人下肢。该肿瘤特征性表达EWSR1::ATF1融合基因。尽管接受扩大切除,约半数患者发生远处转移,5年和10年总生存率仅为50%和38%。传统化疗和放疗效果有限。因此,探索新型有效抗肿瘤药物迫在眉睫。

肿瘤基因解码通过高通量药物筛选发现FDA已批准的泛HDAC抑制剂沃利那司可能是透明细胞肉瘤的有效治疗药物。有趣的是,肿瘤靶向药物基因检测研究发现沃利那司可抑制EWSR1::ATF1的表达。事实上,之前研究显示其他HDAC抑制剂也可抑制透明细胞肉瘤等肉瘤中的融合基因表达,但机制不明。阐明抑制机制有助于开发融合基因靶向治疗。因此,肿瘤精准治疗基因解码着眼探究透明细胞肉瘤中表观遗传学和转录机制调控融合基因表达。此外,靶向药物基因检测还发现了另一种药物可增强EWSR1::ATF1的抑制。

鉴于透明细胞肉瘤极为罕见,开发新药具有一定的困难。大规模基因检测显示该肿瘤可用靶点较少。肿瘤的基因解码发现HDAC抑制剂可直接抑制疾病特异性融合基因或其信号,这是克服该肿瘤的可能方法。与预期相符,肿瘤靶向药物基因检测发现HDAC抑制剂治疗可降低透明细胞肉瘤细胞中EWSR1::ATF1的表达,并着眼阐明下调机制,以促进融合基因靶向治疗的开发。

肿瘤基因解码证实HDAC抑制剂治疗导致EWSR1::ATF1启动子区域组蛋白脱乙酰和转录因子结合降低。有研究显示HDAC抑制剂通过H4多聚乙酰化改变BRD4的结合靶点,上调BRD4结合位点的转录。同样,肿瘤基因检测观察到HDAC抑制剂处理后BRD4与EWSR1::ATF1启动子区域的结合降低。这表明类似的BRD4重定位机制参与HDAC抑制剂所致基因表达下调。

肿瘤基因靶向药物基因解码还发现转录因子SOX10直接调控EWSR1::ATF1,这次发现调控肉瘤融合基因表达的转录因子。肿瘤靶向药物基因检测证实SOX10敲低抑制肿瘤增殖,提示其在该肿瘤生物学中的关键作用。鉴于上述结果,肿瘤靶向药物基因检测及精准治疗探索了包括HDAC抑制剂的联合治疗来降低EWSR1::ATF1。发现HDAC抑制剂降低BRD4与EWSR1::ATF1启动子结合,而BRD4抑制剂可增强基因抑制。这支持HDAC抑制剂和BRD4抑制剂联合治疗的协同作用。

总之,肿瘤靶向药物基因解码基因检测证实沃利那司可能是透明细胞肉瘤有效药物,并揭示其下调EWSR1::ATF1的表观遗传学和转录机制,首次发现了调控该融合基因表达的转录因子,并发现可协同增强融合基因抑制的联合治疗。肿瘤基因解码的研究为开发肉瘤融合基因靶向治疗提供了蓝图,为透明细胞肉瘤治疗带来新曙光。