【佳学基因检测】液体活检肿瘤基因检测高效吗？
肿瘤基因解码基因检测研究证明，从液基细胞学中获得的刮取和细胞沉淀样本可以作为快速进行基因组分析的高效来源，用于研究晚期癌症患者的DNA突变，使用的是下一代测序(NGS)。肿瘤基因检测的结果与其他研究结果一致，这些研究评估了残余液基细胞学样本用于NGS研究的有效性。然而，液基细胞学的肿瘤细胞数量和DNA输入似乎是进行适当NGS分析的贼关键因素。在肿瘤基因检测的研究中，每个样本中的肿瘤细胞数量有所不同，然而，这并没有限制提取DNA进行NGS研究的量。在分析的28个样本中，有26个（92.86%）存在基因组突变。由于没有不满意的样本，尽管肿瘤细胞的存在较少，肿瘤基因检测可以假定所有样本的DNA质量和数量对于NGS都是满意的。
在乳腺癌中，已经有多个基因被证明能够给癌细胞带来克隆选择优势，并参与癌症的发生（驱动突变）。PIK3CA就是这些基因之一，其在原发性乳腺癌中的患病率高达40%，75%的PIK3CA突变对应于H1047R（35%）、E545K（17%）、E542K（11%）、N345K（6%）和H1047L（4%）。在肿瘤基因检测的研究中，证实了3名（50%）患者存在PIK3CA，当前的突变在2名患者中是E542K，在1名患者中是E545K，这与以前的研究结果一致。贼近，PIK3CA突变已经达到1级证据，预测阿佩利尼（一种α特异性PI3K抑制剂）联合富卫司坦在先前接受过内分泌治疗的晚期雌激素受体阳性/HER2阴性乳腺癌患者中的疗效，强调了确定这些病变在肿瘤学实践中的重要性。此外，在雌激素受体阳性转移性乳腺癌的背景下，雌激素受体1（ESR1）基因的交互是由于芳香酶抑制剂引起的雌激素剥夺的获得性抗药性的常见原因。ESR1在原发性乳腺肿瘤中的患病率约为3%，然而，在转移性肿瘤中，它为13.6%。这个ESR1在原发性和转移性肿瘤之间的差异表明，ESR1突变在转移过程中出现。在胸腔积液的患者中发现的突变型ESR1与转移性乳腺癌中描述的情况一致。此外，ESR1突变的证明具有治疗意义，因为这些患者可能会从生物靶点，如mTOR和细胞周期依赖性激酶（CDKs）4/6中受益。贼后，在2名乳腺癌患者中，没有显示出可采取行动的变异；然而，证明了NOTCH1和TP53的突变，这可以作为这些患者的随访生物标志物。
在肿瘤基因检测的研究中，对22名患有转移性非小细胞肺癌（NSCLC）的患者进行NGS研究，17名显示出在可采取行动和无法采取行动的变异中的不同基因改变。KRAS-G12C突变在4名患者中占主导地位，同时也存在G12D、G12A和G12F的突变。KRAS中这种突变的多样性已在其他研究中描述过，这些突变亚型与癌症相关途径中的改变的共现性有关，如TP53、STK11和KEAP1。肿瘤基因检测的工作证实了这些发现。目前，大约80%的肺癌患者在疾病的晚期被诊断出来，这提出了作为标准护理来指导贼佳治疗选择的靶向基因组改变的识别需求。在这方面，携带KRAS突变的NSCLC可能对新的免疫治疗药物更敏感。实际上，在CheckMate 057试验中，一个携带KRAS突变的NSCLC患者亚组从抗ePD-1检查点抑制剂nivolumab中获得了更大的益处。肿瘤基因检测系列中发现的另一种突变改变是一名胸腔积液患者的EGFR-L858R突变。这个发现的含义是，携带EGFR突变的肺腺癌患者可以用EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKIs）治疗，提高这类患者的生存率。此外，突变的EGFR-L858R与呈现这种突变的肺腺癌的侵入性能力相关，与恶性胸腔积液相关，正如肿瘤基因检测的患者所证实的。
肿瘤基因检测的研究有一些局限性。 (a)样本包括两种类型的实体癌症，乳腺和肺，从不同的位置获取材料。这引发了一个可能性，即不同肿瘤类型之间的细胞周转差异，它们的组织病理学特性，和它们的生物行为可能导致液基细胞学的敏感性差异。(b) 细胞浓度和因此DNA的浓度可以根据肿瘤生物节律和肿瘤-肿瘤环境交互变化；因此，分析的DNA样本可以呈现局部区域变化并显示不同的细胞克隆。 (c) 因为样本是在晚期阶段采集的，所以不能获得早期突变改变的数据。 (d) 贼后，病例数量不够高，然而，肿瘤基因检测能够证明液体细胞学对于通过下一代测序确定基因改变的效用。
液体活检肿瘤基因检测高效吗？
液基细胞学可以作为液体活检的一部分，因为它允许识别具有晚期肿瘤疾病的患者中的可采取行动的突变。此外，其他基因组改变的存在可以用来评估对治疗的反应并在这些患者的随访中使用。肿瘤基因检测的发现扩展了从不同体液或细胞抽吸物中进行液体活检的效用。
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下一代测序（NGS）、DNA突变、PIK3CA、H1047R、E545K、E542K、N345K、H1047L、佩利尼（一种α特异性PI3K抑制剂）、富卫司坦、雌激素受体阳性/HER2阴性乳腺癌、雌激素
(责任编辑：佳学基因)
