【佳学基因检测】什么是ATACseq基因检测?

什么是ATACseq基因检测？

ATACseq基因检测的英文全称是assay for transposase-accessible chromatin using sequencing，简称为ATACseq.这主要是一种在基因解码过程中用来了解部分基因序列的检测方法。

ATACseq应用案例：

这是一种快速和敏感的替代DHS定位的方法，DHS定位法需要5000到50000个细胞，使软骨和其他主要关节组织的分析成为可能。在一个具体的基因解码过程中，确定的109215个可接近的染色质区域中，71.1%定位于的增强子区域，4%在受损和未受损OA软骨细胞之间的可接近性发生了改变。几个已建立的OA基因座内的DNA变异序列存在于这些ATACseq峰，56个新OA基因座中有28个的基因序列突变也存在于这些峰中，包括LTBP1、LTBP3和SBNO1。在基因解码过程中，采用ATACseq获得的染色质数据是鉴定软骨中非编码调控区的功能的宝贵资源，并将有助于确定OA风险突变序列和表观遗传变化的优先顺序，拓展了基因突变序列的功能分析。