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【佳学基因检测】MSI基因检测

由于MSI早期检测的局限性和MSI早期机制的不明确,目前只能用一些特异性化疗药物治疗MSI患者,效果并不理想。随着MSI检测技术和免疫抑制剂在肿瘤治疗中的应用,研究人员发现MSI-H肿瘤对免疫

佳学基因检测】MSI基因检测


什么是MSI基因检测

微卫星(MS)又称为短串联重复序列(STRs)或简单序列重复序列(SSRs),由1-6个核苷酸的重复序列组成。小卫星DNA的分布特征不同于15~65个核苷酸串联重复序列,主要位于染色体末端附近。MS分布广泛,大多位于编码区附近,也可能位于其他区域,如内含子或非编码区。每个MS特异位点由中心核和外围侧翼两部分组成,MS的特异性主要是由于核心重复单元数目的变化。

MS的产生机制一般认为是DNA复制过程中的滑移,或DNA复制和修复过程中滑移链和互补链的碱基错配,导致一个或多个重复单元缺失或插入。正常组织DNA修复系统称为错配修复(MMR),可以纠正DNA复制过程中的错误。然而,由于肿瘤细胞中MMR基因的缺失或复制修复过程中的缺陷,基因突变的可能性增加。可见MSI是肿瘤发生发展的重要因素。

根据微卫星不稳定性的发生频率,可分为高微卫星不稳定性(MSI-H)、低微卫星不稳定性(MSI-L)和微卫星稳定性(MSS)。目前临床研究倾向于将MSS-L和MSS归为一类。根据MSI在结直肠癌中的不同分子机制,可分为无明显家族遗传史的结直肠癌(CRC)和有家族遗传史的非息肉病Lynch综合征。基因解码早期发现,MSI病例多为散发性结直肠癌,其原因是由于hMLH1启动子甲基化导致后代基因表达表观失活而未发生基因突变。Lynch综合征是一种由MMR株突变引起的常染色体显性肿瘤综合征,它也可以引起结肠和直肠其他部位的肿瘤。

由于MSI早期检测的局限性和MSI早期机制的不明确,目前只能用一些特异性化疗药物治疗MSI患者,效果并不理想。随着MSI检测技术和免疫抑制剂在肿瘤治疗中的应用,研究人员发现MSI-H肿瘤对免疫治疗反应良好。FDA批准PD-L1(程序性细胞死亡配体1)阻断Keytruda治疗MSI-H/MMR患者。学者们开始对MSI的检测方法、MSI的机制以及MSI与肿瘤的关系等方面进行更深入的研究。

微卫星不稳定性检测(MSI)方法及进展

随着人类基因组计划的实施,科学家们开始进一步研究与人类疾病相关的基因,发现与之相关的微卫星不稳定性,并寻求检测相关方法(表1)。

MSI(微卫星不稳定性(检测方法一览表

检测方法 特点 检测对象 检测精度
NGS 少量样本可以得到精确结果 同乎 100 MS 位点

IMPACT™: 92%

F1CDx: 94.6%

多重荥光PCR and CE

只能得到MSI结果

MSI 分析系统是基于这一方法

5 MS sites: BAT-26, NR-21, BAT-25, MONO-27 and NR-24 Gold standard, 100%
IHC 应用广泛,实用性强,但是只能得到MMR结果 The MMR protein: hMLH1, hPMS2, hMSH2, hMSH6 89–95%
smMIPs Accurate and no matching of normal materials are required for certain diseases: colorectal cancer, prostate cancer, endometrial cancer DNA from tumor tissue 95.80%

NGS next-generation sequencing, PCR polymerase chain reaction, CE capillary electrophoresis, IHC immunohistochemistry, smMIPs single-molecule molecular inversion probes, MMR mismatch repair, MS microsatellite


(责任编辑:佳学基因)
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